Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms