Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pgbd1E9Q492 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pgbd1E9Q492 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms