Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5930D3Z257 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms