Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif28pD3YXS5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms