Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3259D3YUK0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3259D3YUK0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms