Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdzd8B9EJ80 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms