Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zscan5bB2RTN3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zscan5bB2RTN3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms