Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf39A2RT81 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf39A2RT81 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms