Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms