Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samt1A2BED8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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