Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtf1A2AQ19 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rtf1A2AQ19 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms