Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhbdl2A2AGA4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl2A2AGA4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms