Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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