Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Kcna2-202ENSMUST00000196403 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm14799-201ENSMUST00000117502 429 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm5760-201ENSMUST00000119692 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Thnsl1-202ENSMUST00000102951 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Wdr95-201ENSMUST00000110502 2482 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Zfp39-201ENSMUST00000102703 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Lrrfip1-203ENSMUST00000097649 3645 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm28048-201ENSMUST00000160826 2746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Zfp69-202ENSMUST00000106281 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Vill-201ENSMUST00000051386 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Pear1-203ENSMUST00000090981 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Rasgrf1-203ENSMUST00000189545 4766 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Mlst8-201ENSMUST00000070888 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chic1Q8CBW7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chic1Q8CBW7 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chic1Q8CBW7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chic1Q8CBW7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Chic1Q8CBW7 Ddx39-206ENSMUST00000172396 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm25306-201ENSMUST00000175288 117 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Chic1Q8CBW7 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Zwint-201ENSMUST00000020081 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Kcns3-202ENSMUST00000164495 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Tmem167b-201ENSMUST00000090546 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chic1Q8CBW7 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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