Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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Ccl20O89093 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms