Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Sp100O35892 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sp100O35892 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms