Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms