Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Traf3ip1Q149C2 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms