Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms