Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CipcQ8R0W1 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CipcQ8R0W1 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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