Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ubash3bQ8BGG7 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms