Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms