Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NischQ80TM9 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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