Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ccdc18Q640L5 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms