Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprkP35822 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprkP35822 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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