Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms