Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd9P28357 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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