Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
XntrpcF8VQM8 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms