Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rb1cc1Q9ESK9 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms