Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrit3W8DXL4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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