Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt27Q9Z320 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms