Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl40Q9Z2Q5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms