Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp18Q9WTV6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms