Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb2Q9R1P3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb2Q9R1P3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms