Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zeb2Q9R0G7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms