Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr54Q9R0D8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr54Q9R0D8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms