Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndrg3Q9QYF9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndrg3Q9QYF9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms