Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx4Q9QY61 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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Irx4Q9QY61 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx4Q9QY61 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx4Q9QY61 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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