Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ChmQ9QXG2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChmQ9QXG2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms