Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Higd1aQ9JLR9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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