Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Bco1Q9JJS6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Bco1Q9JJS6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Bco1Q9JJS6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Bco1Q9JJS6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bco1Q9JJS6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Bco1Q9JJS6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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