Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms