Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dap3Q9ER88 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms