Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scn4aQ9ER60 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scn4aQ9ER60 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms