Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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