Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pop5Q9DB28 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms