Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtm2aQ9DAR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm2aQ9DAR1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms