Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Usp12Q9D9M2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp12Q9D9M2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp12Q9D9M2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp12Q9D9M2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Usp12Q9D9M2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp12Q9D9M2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Usp12Q9D9M2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Usp12Q9D9M2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp12Q9D9M2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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