Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9K8

Iqcf1, IQ domain-containing protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf1Q9D9K8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Iqcf1Q9D9K8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms