Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg7Q9D906 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg7Q9D906 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg7Q9D906 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms